目前常用的无菌包装形式有无菌纸板包装、无菌杯式包装、无菌大袋灌装机、无菌铝、塑袋包装和无菌塑料瓶包装等。
无菌大袋灌装机是指包装容量为5到220升大可达1000升的复合袋包装。灌装后的袋子装在木质或纸板制成的外包装箱中或钢桶中，主要包装浓浆或基料为5到20升的产品，也可直接供家庭消费。目前无菌大袋灌装机这种包装形式已基本取代了由铁桶或塑料桶做外包装，再在食品内加防腐剂保存食品的包装方法。大袋包装的材料结构有两种形式：PET膜、铝箔、PE膜或PET镀铝膜、PE膜采用干式复合的方法复合。由于镀铝膜易有气孔，不能保证其阻隔性能，因此，我国一般都采用铝箔做阻隔材料。
无菌铝、塑包装的包装方法类似于无菌纸包装，只不过使用的材料是铝、塑复合膜。包装形式是袋装，所用的包装膜多采用干式复合和流延复合的方式。
无菌瓶包装采用共挤塑料瓶或单组分的PP和PE。塑料瓶可以在成型时灭菌，并立即灌装也可以在灌装前灭菌，灭菌的瓶子在无菌室中灌装和压盖。
液体食品采用无菌包装已成为上比较流行的趋势。其中尤以铝箔复合纸包装较为普遍，原因是这种包装形式能使被包装之物保存于不透光、不透气、无菌的理想环境中，在常温下也能保持12个月以上，且品质不变。同时，其质量较轻也较适合长途运销。
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